Esse importante museu foi fundado em 1926, por Rafael Larco Hoyle, na cidade de Hacienda Chiclín, e foi transferido para uma construção do século XVIII em Lima nos anos 50.
A coleção teve início com as peças que havia herdado do pai, em 1923.
Atualmente, o museu conta com mais de 11 mil peças em seu acervo, entre elas peças em cerâmica, objetos de metal, artefatos incas, entre outros, que contam a história do país desde a era pré-colombiana.