A Estância de Águas Termais, ou Baños Termomedicinales, está localizada no ponto mais alto de Águas Calientes, a cerca de 800 metros de altitude. Lá estão algumas piscinas termais ao ar livre, com tamanhos diferenciados.
As águas, que se acredita que possuem poderes curativos, são encontradas com várias temperaturas, variando entre 38°C a 46°C. Há também uma com água gelada da montanha. De acordo com a composição química da água e sua temperatura, são recomendadas para doenças de pele, artrite entre outras.
As piscinas termais podem ser encontradas após uma caminhada de cerca de 15 minutos a partir da praça principal da cidade. A estância disponibiliza instalações para o cliente, como vestuários, chuveiros, armários e uma pequena lanchonete.