Esta linda igreja, em estilo barroco andino, foi construída em 1571 sobre o antigo palácio inca de Huyna Capac, inicialmente como uma capela para os indígenas, com o nome de Nossa Senhora de Loreto. Fica ao lado da Catedral de Cuzco, na Praça de Armas.
Foi atingido por um terremoto em 1650 e passou por uma reforma por quase 40 anos. Atualmente, possui duas capelas em cada lado, entre elas a Capela da Virgen de Loreto e a Capela de San Ignacio Loyola. Seu altar tem 21 metros de altura e é todo trabalhado em madeira, com revestimento em ouro.
Um dos diversos quadros espalhados no interior é o que retrata o matrimônio de Martín García de Loyola, parente do fundador da ordem jesuíta, e Beatriz Clara Coya, a herdeira da coroa dos incas.